以成为神奇宝贝大师为目标，小智（松本梨香 配音）、小刚（うえだゆうじ 配音）和小光（豊口めぐみ 配音）带着各自的神奇宝贝在世界各地进行艰苦的修业之旅，今天他们历经长途跋涉终于来到了风景秀美的米琪亚镇。在当地一对小兄妹的介绍下，小智一行前往神殿遗址游玩。谁知却遭遇了极其危险的情况。关键时刻，掌管时间的迪亚鲁加和守卫神殿的西娜（北乃きい 配音）、凯宾（岸祐二 配音）帮助了他们，能与神奇宝贝心灵沟通的西娜还熄灭了冥王龙的怒火。从西娜口中得知，创造了世界的神奇宝贝即将苏醒，它不仅会使时空扭曲错乱，还将为世界带来毁灭性的灾难…… 本片为神奇宝贝系列第十二部电影剧场版。
演员：美山加恋 福原遥 村中知 藤田咲 森奈奈子 水濑祈 金井美香 水岛裕 皆川纯子 盐屋翼 上田祐司 千叶千惠巳 平川大辅 江川央生 竹内良太 虎岛贵明 金子诚 涩谷彩乃 引坂理绘 真木骏一 中泽匡智 祖山桃子 齐藤真知子 藤井雪代 尾畑美依奈 铃木绘理 间岛淳司 佐藤朱 西村太佑 鸟海浩辅 鱼建 驹形友梨 宫本佳那子 恒松步 津田健次郎 山口由里子 小村哲生 中村英香 佐藤拓也 天野由梨 宫泽清子 本渡枫 安野希世乃
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